首個(gè)山羊基因組圖譜完成

首個(gè)山羊全基因組圖譜在《自然?生物技術(shù)》（Nature Biotechnology）雜志在線(xiàn)發(fā)表。

　　本研究由中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成。

　　山羊是最早被人類(lèi)馴化的動(dòng)物之一。已有證據(jù)表明，山羊最早起源于中亞細(xì)亞一帶的角羊，目前在全球范圍內(nèi)尤其是中國(guó)、印度及其他發(fā)展中國(guó)家被廣泛飼養(yǎng)。從人類(lèi)文明起始，山羊便為人類(lèi)提供肉、奶、皮、毛等，逐漸成為農(nóng)業(yè)和經(jīng)濟(jì)發(fā)展的重要支柱。此外，山羊現(xiàn)在還可作為生物醫(yī)學(xué)研究的模型，用于復(fù)雜性狀的遺傳學(xué)基礎(chǔ)研究。盡管其重要性如此之高，由于缺乏參考基因組，目前對(duì)山羊的遺傳育種研究還略顯滯后，而山羊基因組測(cè)序?qū)τ谶z傳標(biāo)記輔助育種、改善山羊的經(jīng)濟(jì)性狀具有重要作用。

　　在本研究中，科研人員對(duì)一只雌性云南黑山羊進(jìn)行了全基因組測(cè)序。

　　通過(guò)比較基因組分析，研究人員發(fā)現(xiàn)山羊與牛的親緣關(guān)系較近，二者大約在2300萬(wàn)年前分化。此外，山羊基因組中約有44個(gè)基因受到正選擇，其中7個(gè)與免疫相關(guān)，這與在�；�因組中是一致的；另外還有3個(gè)垂體功能相關(guān)的基因發(fā)生快速進(jìn)化，這可能與產(chǎn)奶量、胚胎發(fā)育速度以及羊毛變化等相關(guān)。隨后，研究人員進(jìn)一步分析了山羊基因家族擴(kuò)張與收縮情況。他們發(fā)現(xiàn)3個(gè)與味覺(jué)受體相關(guān)的基因亞家族發(fā)生擴(kuò)張，而僅有1個(gè)亞家族收縮，推測(cè)這可能與山羊的覓食能力相關(guān)；同時(shí)還發(fā)現(xiàn)鐵蛋白重鏈多肽-1基因（FTH1）擴(kuò)張至人類(lèi)的7倍、牛的2倍，并推測(cè)這可能與山羊強(qiáng)大的解毒及覓食能力相關(guān)。因?yàn)殍F蛋白在鐵離子螯合、解毒和貯存中發(fā)揮著重要作用。

　　哺乳動(dòng)物的毛發(fā)是由皮膚毛囊生成的高度角質(zhì)化的組織，有兩種不同類(lèi)型的毛囊，初級(jí)毛囊存在于所有哺乳動(dòng)物中僅產(chǎn)生被毛，而次級(jí)毛囊則存在于山羊等動(dòng)物中產(chǎn)生羊絨和細(xì)羊絨，而羊絨纖維主要從絨山羊獲得。雖然中國(guó)具有悠久的羊絨生產(chǎn)歷史，并且是全球最大的羊絨生產(chǎn)國(guó)，但是對(duì)于羊絨形成和發(fā)育的分子機(jī)制卻知之甚少。

　　在本研究中，研究人員對(duì)初級(jí)毛囊和次級(jí)毛囊進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組研究，以鑒定不同毛囊中的分子變化。

　　華大基因副院長(zhǎng)、該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人徐訊表示，“通過(guò)結(jié)合第二代測(cè)序技術(shù)與全基因組酶切圖譜技術(shù)完成的山羊基因組圖譜，為分子標(biāo)記輔助山羊育種奠定了基礎(chǔ)，將促進(jìn)反芻類(lèi)的比較基因組學(xué)的研究。對(duì)絨山羊初級(jí)毛囊和次級(jí)毛囊轉(zhuǎn)錄組的比較分析，將為絨山羊羊絨品質(zhì)的改良提供新方向�！�